Rares sont ceux qui connaissent exactement les risques  pour la santé liés à la consommation d’une eau de qualité douteuse et les précautions à prendre pour préserver une eau de bonne qualité.
Un entretien régulier des installations contribuera à diminuer les risques d’apparition de contamination.
Par contre, si l’eau est déjà contaminée, une désinfection ponctuelle des ouvrages doit être réalisée au plus vite, suivi d’un examen attentif des points sensibles de ces ouvrages (cf. fiche « entretien »).

Si par la suite, malgré cette action, la contamination devait perdurer, il sera indispensable de mettre en place un traitement permanent  (chlore ou rayonnement ultraviolet).

Le fait qu’une eau soit limpide et claire ou « semble propre » n’est pas une garantie de bonne qualité.
Le seul moyen de différencier une eau de mauvaise qualité d’une eau de bonne qualité, est de la faire analyser par un laboratoire spécialisé.

Pour les établissements recevant du public (restaurants, auberges, campings, centres de vacances, centres de loisirs, club house, entreprises agro-alimentaires, laiteries, petits producteurs fermiers, etc…) alimentés par une ressource privée, la réglementation impose aux responsables de se déclarer auprès du service santé environnement de l'ARS pour qu’un suivi sanitaire de la qualité de leur eau soit effectué.

Depuis le 1er janvier 2009, tout particulier utilisant ou souhaitant réaliser un ouvrage de prélèvement d’eau souterraine (forage ou puits) à des fins d’usage domestique doit déclarer cet ouvrage ou son projet en mairie.